В период обороны Севастополя в 1941-42-х годах, на вершине горы были установлены два орудия с поврежденного эсминца «Совершенный», а в башне размещались артиллеристы; в ходе боевых действий башня была вновь разрушена.
Вторично башню отреставрировали в 1956 году, а на фасаде в стены были вмонтированы две мемориальные доски с перечнем воинских частей, защищавших Малахов курган с 5.10.1854 г по 27.08.1855г. После второй мировой войны был установлен памятник летчикам 8-й воздушной армии, которая в 1944 году освобождала Севастополь.
23 февраля 1958 года на оборонительной башне был зажжен факел Вечного огня, а в 1963 году в башне была открыта экспозиция, рассказывающая о событиях, происходящих на Малаховом кургане в годы Крымской и Великой Отечественной войн. В музее находится коллекция вооружения, обмундирования и снаряжения русской армии периода Крымской войны.
На кургане находится красивый парк, в котором после Второй Мировой войны высадили 2,5 тыс. лиственных и 1,5 тыс. хвойных деревьев. Главная аллея парка - Аллея Дружбы, на которой деревья были посажены лично главами государств и правительств разных стран, космонавтами, официальными делегациями городов-героев. На алее находится старое дерево, окруженное небольшим заборчиком – это миндаль, уцелевший после двух оборон города.
С высоты Малахова кургана можно полюбоваться великолепным видом на Севастополь, его бухты, центральный городской холм и Корабельную сторону.