Из хищников в области встречаются бурый медведь, рысь, лиса, лесной дикий кот, волк, ласка, хорёк, горностай, выдра, барсук, по два вида куниц и норок, а также акклиматизированная дальневосточная енотовидная собака.
Горностай, выдра, рысь, барсук, и лесной кот занесены в Красную книгу Украины. Закарпатская популяция исчезающего лесного кота состоит из более чем 500 особей. Изображенный на гербе области бурый медведь (более 200 особей) на территории Украины встречается только в Карпатах.
В Закарпатской области также водятся насекомоядные (ёж, крот, бурозубки, белозубки), грызуны (от альпийской снеговой полевки до степного хомяка), зайцеобразные (заяц-русак), рукокрылые (большинство из которых занесены в Красную книгу). Некоторые виды животных области (серна, заяц-беляк) были уничтожены в XIX- XX веках.
В Закарпатье водится 281 вид птиц, что составляет более 80 % всей орнитофауны Украины, из которых гнездовых - 127 видов (44 %), оседлых – 60 (23 %), перелетных – 48 (17 %), залетных (13 %), зимующих – 8 (3%).
В частности, оседлыми являются тетерев, рябчик, глухарь, серая куропатка, фазан, совы, филин, неясыть, сыч, беркут, большой и малый ястребы, сойка, зяблик, жаворонок. Весьма распространены иволга, дрозд, сорокопут, утки, ласточки.
Под особой защитой находятся уникальные популяции хищных и совообразных птиц, поскольку практически все охраняемые украинские птицы этих отрядов – филин, беркут, змееед, мохноногий сыч, орёл-карлик, сокол-сапсан, скопа встречаются в области. Высокогорные темнохвойные леса Карпат населяют глухари, рябчики и тетерева.
В Закарпатье встречаются 13 видов пресмыкающихся, включающих 1 вид черепах и несколько видов змей и ящериц (гадюка обыкновенная и медянка, эскулапов полоз, ужи обычный и водный). Представлены в области и все земноводные, присутствующие в стране – 17 видов, среди которых тритоны обыкновенный, гребенчатый, карпатский и альпийский, саламандра пятнистая, квакша обычная, жаба зеленная, лягушки прыткая, озерная и травяная.
В водоемах Закарпатской области водится 57 видов рыб, характерных для бассейна Дуная. Для горных рек типичны лососевые (лосось дунайский, форель, хариус), для равнинных – карповые (карп, карась, плотва, марена обыкновенная, елец, толстолобик, голавль), судак, сом, ёрш обыкновенный, окунь, лещ, линь, щука.
Для сохранения флоры и фауны в Закарпатье открыт целый ряд заповедных территорий, в которых насчитывается 2 тыс. растений и 350 видов млекопитающих и птиц. Общая площадь охраняемых территорий и заповедных объектов составляет 12,5 % территории Закарпатской области.
В 1989 году в верховьях реки Теребли был создан Национальный природный парк «Синевир», где на площади 40,4 тыс. га сохранились буковые, смешанные, хвойные леса и высокогорные луга. Здесь охраняются около ста видов редчайших растений и целый ряд видов редких позвоночных животных – благородный олень, бурый медведь, рысь, дикий кабан, глухарь, пятнистая саламандра, форель.